Bad Bederkesa liegt inmitten des grünen Küstenlandkreises Cuxhaven zwischen Elbe Weser und Nordsee, im sogenannten Cuxland. Der Bederkesaer-Geeste-Kanal und der sich anschließende Hadelner Kanal verbinden als Wasserstraße die Flüsse Elbe und Weser (Elbe-Weser-Schifffahrtsweg).